На территории регионального природного геологического заказника «Качинский каньон» встречается большое количество краснокнижных и редких растений. Повсеместно произрастает Можжевельник колючий, на ветвях которого иногда можно рассмотреть Арцеутобиум можжевельниковый.
Это полу-паразитическое растение, которое поселяется на корнях и ветвях Можжевельника колючего. Встречается достаточно часто, однако его сложно рассмотреть, так как почти полностью сливается с ветвями дерева-хозяина.
На вершине можно было увидеть несколько видов орхидей и уже отцветшие Пионы.
Весьма красиво смотрелся Лен шерстистый.
На каменистых и меловых склонах под скалами произрастает Гармала.